磁気ポンプには、従来のメカニカルシールポンプに比べて次の利点があります。
漏れなし：磁気ポンプは磁力によって駆動され、メカニカルシールを必要としません。真の漏れのない動作を実現し、液体漏れによる環境や機器への汚染や損傷を回避できます。
無公害: 磁気ポンプにはメカニカルシールがないため、漏れによる汚染の問題がなく、揮発性、有毒、有害、可燃性などの特殊な媒体の搬送に適しています。
摩擦なし: 磁気ポンプのインペラとポンプ本体の間に接触がないため、従来の機械式ポンプの摩擦によって引き起こされる磨耗やエネルギー消費が回避されます。
ポンプ漏れなし: 磁気ポンプは静的または動的シールを使用してポンプ漏れのない動作を実現し、従来の機械式ポンプのポンプ漏れによって引き起こされる液体の無駄や汚染を回避します。
低騒音：磁気ポンプの羽根車はベアリングに直接接触する必要がないため、従来の機械式ポンプに比べ騒音が低くなります。
ただし、磁気ポンプには次のような欠点もあります。
高コスト：磁気ポンプは高度な技術と材料を使用しており、コストが比較的高いため、価格も従来の機械式ポンプよりも高くなります。
低効率：磁気ポンプの磁力変換効率はメカニカルトランスミッションほど高くないため、エネルギー効率は若干低くなります。
専門的なメンテナンスが必要：磁気ポンプの動作原理は従来の機械式ポンプとは異なるため、専門的なメンテナンスと手入れが必要です。